因多次从台湾地区输大陆番荔枝和莲雾中检出检疫性有害生物——大洋臀纹粉蚧。为防范植物疫情风险，依据大陆有关法律法规和标准，海关总署发布通知决定自2021年9月20日起暂停台湾地区番荔枝和莲雾输入大陆，这是继台湾菠萝被禁止输入大陆后又一次因植物检疫被禁入的水果。据台湾《中国时报》报道，台农业主管部门“农委会”主委陈吉仲点名下波可能遭大陆禁止的水果是柑橘类。

对此，有柑农忧心以往出口的量若回销，势必冲击岛内市场价格，也有果农讽刺陈吉仲又在做政治操作。嘉义县椪柑产量全台第一，农业处长许彰敏强调以内销为主，外销大陆占比不高，若真禁止影响不大。台中市约有500公吨茂谷柑外销大陆，农业局则说将加强销往其他市场。

包括新竹县、苗栗县、台中市、嘉义县、台南市等地都大面积种植柑橘。许彰敏指出，嘉义县椪柑产量虽全台第一，但以内销为主，全年外销总量约1000吨至1200吨，加上外销市场主要是东南亚、新加坡和香港，大陆占比并不高，若大陆禁止台湾椪柑进口，对嘉义产地影响不大。

但嘉义县竹崎乡农会总干事林孟怡说，竹崎椪柑主要送北农或行口，以岛内市场为主，贸易商收购出口也以香港为主，释迦、莲雾被大陆暂停输入后，果农或多或少会担心，以往出口的量会回销到岛内市场造成冲击，但因今年曾有旱灾，预期椪柑产量将减少，届时如被大陆禁止进口，市场价格尚难预料。

也有台南的农友忧心说，大陆宣布禁止进口台湾释迦、莲雾，第一时间陈吉仲不想办法跟大陆坐下来谈，反而呛要向WTO控诉，这对局面有帮助吗？到头来受伤的还是农民。农产品第1、2年无法销到大陆，久了人家就不会想再买台湾的农产品，以后销大陆市场一定会DOWN下来。

苗栗县种植柑橘面积约1600公顷，其中以茂谷、椪柑、桶柑等为大宗，近年来更流行栽种来自大陆的砂糖橘。马当局时代，曾有少数茂谷柑销往大陆，民进党“执政”后几乎全停，都靠内需市场，尤其今年旱灾严重损伤，如今陈吉仲“预告”大陆拒收柑橘一事，苗栗柑农闻言，立即暗讽又在政治操作。

根据农委会统计，自2018年至2020年，输往中国大陆的水果以菠萝12.2876万吨最多，其次为释迦3.92万吨、莲雾1.25万吨、文旦1.13万吨、芒果1.87万吨、柑橘9505吨。